MALADIES INFECTIEUSES
&
INTELLIGENCE ARTIFICIELLE

Équipe du projet
« Jumeaux numériques de bactéries pathogènes »
Le projet « Ágnes, Jumeaux numériques de bactéries pathogènes » rend hommage à la professeure Ágnes Ullmann (1927-2019), microbiologiste pasteurienne, qui a participé à l’essor exceptionnel de la biologie moléculaire dans les années 1960.
Il vise à créer des jumeaux numériques de bactéries pathogènes pour prédire leur comportement et ainsi mieux lutter contre les menaces infectieuses. En utilisant l’intelligence artificielle et des modèles multimodaux, les chercheurs vont simuler le fonctionnement des bactéries pour mieux comprendre leur résistance aux traitements et leur virulence, et pour concevoir des solutions thérapeutiques innovantes.

Exploiter la puissance de l’intelligence artificielle
À l’heure où l’intelligence artificielle redéfinit les frontières du possible, avec les avancées des modèles de langage de grande taille et l’émergence des modèles capables de combiner plusieurs niveaux d’information (modèles dits multimodaux), obtenir un modèle capturant le fonctionnement d’une cellule entière, combinant plusieurs échelles (de l’information moléculaire telle que le génome, aux caractéristiques fonctionnelles telles que la mobilité, la résistance aux antibiotiques, la virulence, etc.) devient un horizon envisageable.

Prédire les propriétés et comportements des bactéries
En entraînant leur modèle sur d’immenses ensembles de données génomiques bactériennes, combinés à des données expérimentales obtenues par leurs laboratoires, les chercheurs pourront simuler le fonctionnement des bactéries les plus menaçantes pour l’humanité pour prédire leurs comportements et concevoir efficacement les moyens innovants pour répondre aux menaces infectieuses de santé publique telles que l’antibiorésistance.

Fédérer un réseau international
Conscients que rien ne se fait sans collaborations externes majeures, les chercheurs réuniront un cercle d’experts, scientifiques et entrepreneurs, pour dessiner les contours d’un projet collaboratif à grande échelle.
Les chercheurs ont pour objectif de développer des modèles d’intelligence artificielle multimodaux et de mener des expérimentations in silico pour répondre à des questions cruciales :
Que se passera-t-il si une bactérie rencontre tel antibiotique ?
Comment une mutation génétique affectera-t-elle sa capacité à se pro pager ?
Quel est le talon d’Achille d’un nouveau pathogène émergent ?



